Par Ian Gormely

Un groupe de chercheurs, dont Bo Wang, membre de la faculté Vecteur, a mis au point l'outil de génotypage COVID-19 (CGT), qui permet de suivre l'évolution du génome viral de la pandémie actuelle de COVID-19. Leurs travaux ont été publiés dans la revue The Lancet.

Le virus SARS-CoV-2, responsable du COVID-19, mute au fur et à mesure qu'il se déplace d'une personne à l'autre. En suivant cette évolution, les chercheurs peuvent se faire une meilleure idée de l'histoire de la pandémie - où la transmission a probablement eu lieu, où et quand les épidémies se sont produites et, surtout, comment le virus a évolué.

La compréhension de l'évolution virale a des implications directes sur la conception des vaccins, le développement des médicaments et nos efforts pour contrôler la pandémie.

Développée en collaboration avec Hassaan Maan, doctorant de Wang, et des chercheurs de l'Université McMaster et du Sunnybrook Health Sciences Centre, CGT propose une application web conviviale basée sur l'IA qui permet aux chercheurs de mieux comprendre l'histoire et les perspectives de la pandémie de COVID-19. Elle permet aux chercheurs non seulement d'analyser les génomes viraux accessibles au public, mais aussi de télécharger en toute sécurité des données internes de séquençage du génome viral, qui peuvent être retraitées pour être comparées aux données publiques.

"Ce faisant", explique Wang, qui est également responsable de l'IA au Peter Munk Cardiac Centre et titulaire d'une chaire d'IA CIFAR au Canada, "ils peuvent déterminer le contexte des événements locaux par rapport à l'image globale, contribuer à l'élaboration de la politique de santé locale et alerter la communauté de tout changement important dans l'évolution virale".