Les chercheurs ont développé un outil de génotypage compatible avec l’IA qui peut analyser les données du génome viral à partir d’un écouvillon nasal. Notamment, il peut être utilisé pour déterminer différents variants préoccupants (COV) de la COVID-19.

L’outil a été développé par le chercheur de Vector Bo Wang et son équipe dans le cadre du réseau Viral AI développé par la société technologique ontarienne DNAStack et le projet COVID Cloud Supercluster. « Notre outil prend de grandes quantités de données de génomes viraux comme référence et utilise le ML pour apprendre une représentation utile des génomes viraux », explique Wang.

L’IA virale est propulsée par un logiciel développé avec le soutien du projet fédéral COVID Cloud Supercluster. Il offre une alternative au modèle centralisé, où les données sont téléversées dans une seule base de données. Au lieu de cela, elle utilise une architecture fédérée pour connecter, analyser et partager les données sans les déplacer, ce qui permet une réglementation plus rapide et plus efficace
Conforme, et à une gestion des données souveraine régionale.

La province de l’Ontario travaille actuellement avec DNAStack pour créer une base de données qui organise les données génomiques et une plateforme qui visualise ces données en temps réel pour le génotypage des COV. Une fois mis en place, ces outils numériques aideront à améliorer la capacité des responsables de la santé publique à identifier les COV et à aider la planification gouvernementale de la réponse à la pandémie.

Wang et son équipe travaillent actuellement uniquement avec des données sur la COVID-19, mais il affirme que leur outil pourrait être réutilisé pour n’importe quel autre virus, comme la grippe commune.