Des chercheurs ont mis au point un outil de génotypage basé sur l'intelligence artificielle , capable d'analyser les données du génome viral à partir d'un prélèvement nasal. Cet outil permet notamment d'identifier différentes variantes préoccupantes (VOC) du COVID-19.
Cet outil a été développé par Bo Wang, chercheur chez Vector, et son équipe dans le cadre du réseau Viral AI, mis au point par la société technologique ontarienne DNAStack et le projet COVID Cloud Supercluster. « Notre outil utilise de grandes quantités de données de génomes viraux comme référence et utilise l'apprentissage machine pour obtenir une représentation utile de ces génomes », explique Wang.
Viral AI est basé sur un logiciel développé avec le soutien du projet fédéral COVID Cloud Supercluster. Il offre une alternative au modèle centralisé, où les données sont chargées dans une base de données unique. Au lieu de cela, il utilise une architecture fédérée pour connecter, analyser et partager les données sans les déplacer, ce qui permet un traitement plus rapide, plus efficace et conforme à la réglementation.
une gestion des données conforme et souveraine au niveau régional.
La province de l'Ontario collabore actuellement avec DNAStack à la création d'une base de données organisant les données génomiques et d'une plateforme permettant leur visualisation en temps réel pour le génotypage des COV. Une fois mis en place, ces outils numériques contribueront à améliorer la capacité des responsables de la santé publique à identifier les COV et faciliteront la planification des interventions gouvernementales en cas de pandémie.
Wang et son équipe travaillent actuellement uniquement avec des données sur la COVID-19, mais il affirme que leur outil pourrait être réutilisé pour tout autre virus, comme la grippe saisonnière.
