Par Ian Gormely
Une équipe de chercheurs, dont Bo Wang, membre du corps professoral de Vector, a mis au point l'outil de génotypage COVID-19 (CGT), qui permet de suivre l'évolution du génome viral de la pandémie actuelle de COVID-19. Leurs travaux ont été publiés dans la revue The Lancet .
Le virus SARS-CoV-2, responsable de la COVID-19, mute au fil de sa transmission interhumaine. En suivant cette évolution, les chercheurs peuvent mieux comprendre l'histoire de la pandémie : les lieux probables de transmission, les zones et les dates d'apparition des foyers épidémiques et, surtout, l'évolution du virus.
Comprendre l'évolution virale a des implications directes pour la conception de vaccins, le développement de médicaments et nos efforts pour contrôler la pandémie.
Développée en collaboration avec Hassaan Maan, doctorant de Wang, et des chercheurs de l'Université McMaster et du Centre des sciences de la santé Sunnybrook, CGT propose une application web conviviale basée sur l'IA qui permet aux chercheurs d'analyser l'historique et les perspectives de la pandémie de COVID-19. Elle leur permet non seulement d'analyser les génomes viraux accessibles au public, mais aussi de télécharger en toute sécurité leurs propres données de séquençage de génomes viraux, lesquelles peuvent être retraitées pour être comparées aux données publiques.
« Ce faisant », explique Wang, qui est également responsable de l’IA au Centre cardiaque Peter Munk et titulaire de la chaire d’IA du CIFAR Canada, « ils peuvent déterminer le contexte des événements locaux par rapport à la situation mondiale , contribuer à façonner la politique de santé locale et alerter la communauté de tout changement important dans l’évolution virale. »
